L’organo superiore della Fondazione è il Consiglio di Fondazione composto da 5 a 7 membri, di cui possibilmente uno designato dal Consiglio di Stato del Cantone Ticino. Esso si costituisce e completa per cooptazione. Il Consiglio di Fondazione è legittimato a deliberare su tutte le questioni di ordinaria e straordinaria amministrazione e le sue decisioni sono autonome e inappellabili.
Attualmente è composto dai seguenti membri:

Avv. Dr. Pier Mario Creazzo
Presidente

Franco Spinelli
Vice presidente

Ing. Alfio Casanova
Membro

Dr. Med.Walter Cereda
Membro

Avv. Simone Creazzo
Membro

Guido Santini
Membro rappresentante dello Stato

Roberto Grassi
Membro